永仁县自然资源丰富,境内探明的矿藏主要有铜、银、铂、石膏、石英砂、镍、煤、大理石、花岗岩共计10种。境内土壤共有棕壤、黄棕壤、红壤、紫色土、冲积土、石灰土和水稻土7个土类,14个亚类,24个土属,45个耕作土种。全县耕地面积19507.14公顷(29.26万亩),园地面积19030.37公顷(28.55万亩),林地面积150675.20公顷(226.01万亩),草地面积7978.24公顷(11.97万亩),湿地面积116.48公顷(0.17万亩),水域面积3953.21公顷(5.93万亩)。全县森林覆盖率为63.89%,生活着植物1120种、动物248种,其中国家级重点保护野生植物35种、国家重点保护动物41种。
全县主要景区有方山国家AAAA级旅游景区、外普拉国家AAA级旅游景区,有国家级传统保护村落6个(外普拉大村、中和村、直苴村、的鲁村、老怀哨村、阿朵所村)、省级乡村旅游特色村3个(火把新村、麦拉山、诸葛营村)、省级旅游名村1个(外普拉村)、省级金牌旅游村1个(外普拉村)、中国乡村旅游模范村1个(诸葛营村)、中国最美休闲乡村1个(太平地村)、省级民族特色旅游村寨1个(彝人新村)、省级最美乡愁地1个(外普拉大村)、州级民族文化生态旅游村1个(诸葛营村),有银杏庄园、宜就龙潭、中和老街、龙虎峡、维的“十里樱桃谷”、金沙傣寨、大石门、大雪山、莲池溪谷等一批乡村旅游景点。有县级以上文物保护单位30个(其中:省级4个、州级3个),未定级不可移动文物保护单位11个。建有文化保护区1个(永仁县中和镇直苴村彝族传统文化生态保护区)。境内民族文化旅游节庆主要有直苴彝族赛装节、傣族泼水节、彝族火把节、彝族年等。名特产品主要有苴却砚、松露、彝族刺绣品、核桃、板栗、葡萄、油橄榄、金丝小枣、樱桃、草莓、野生菌、冬桃、晚熟芒果、释迦果等。
永仁县为金沙江水系,金沙江沿境内的中和(万马)、永兴和永定3个乡(镇)边缘流过,主要河流有万马河、永定河、羊蹄江、江底河、永兴河、白马河6条。截至2024年底,全县共有小(1)型水库17座,小(2)型水库117座,小坝塘358座。